OpenWorm：ブラウザの線虫ワームのデジタルモデル

長さ約1ミリメートルの小さな線虫、または円形の線虫Caenorhabditis elegansは 、地球上で最も研究されている生物の1つです。 これは、ゲノムが完全に配列決定された最初の多細胞生物です。 C. elegansには2つの性別があります-男性とhermafords。 成人の片麻痺者は959個の細胞で構成され、その神経系は302個のニューロンで構成されています。 C. elegansニューロン間のすべての接続（接続）も完全に記述されています。 このワームに関する豊富な包括的な科学情報と数年前のその設計の比較的単純さは、A.P。Ershov SB RASにちなんで名付けられたコンピューターサイエンス研究所の複雑なシステムのモデリング研究室のスタッフを刺激して、 C。elegansの包括的なコンピューターモデルを作成しました。



時間が経つにつれて、このプロジェクトは世界中の数十人の参加者を引き付けましたが、一般の人々にはほとんど知られておらず、アクセスできませんでした：言うことなく、ワームのデバイスとモデルの多くのサブシステムに関する初期データの豊富さを把握することはそれほど容易ではありませんでしたこれらすべてをコンピューターにインストールして実行する方法については既に説明しています。 同時に、C。elegansは生物学の研究で広く使用されており、ワームモデルを「駆動」する能力を、それがどのように機能するかを検討する詳細とダイナミクスで過大評価することは困難です。 そのため、プロジェクトチームはモデルをオンラインで利用可能にすることを決定しました。これにより、誰でもプロジェクトのWebサイトにアクセスして、仮想生物が住んでいる「マトリックス」を調べることができます。 これがKickstarterのOpenWormプロジェクトの本質です。







モデルの作成者は、12万ドルを集めることを期待しています。 初日には、この金額の約10％が収集されたため、成功する可能性はかなり高くなります。 49ドルからの寄付を希望する支援者には、プロジェクトのウェブサイトでC. elegansの個人モデルを作成し、その「生活」を観察する機会が与えられます。3次元視覚化を使用して内側と外側から身体を研究し、個々の細胞まで、その生命の詳細を観察します



さらに、ワームのデバイスと、そのモデルの作成に使用されるアルゴリズムとテクノロジーの両方を説明するオンラインコースが作成されます。 モデルのすべてのソースコードは、引き続きオープンライセンスで利用できます。 彼らは、この夏、OpenWormアカデミーオンラインコースを開始することを約束し、来春にワームシミュレーションでサイトでの作業を完了する予定です。