バイオインフォマティクスサマースクール

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親愛なる読者のこの投稿では、100人以上の人々が知識週間を使って夏の楽しい1週間を過ごす方法について簡単に説明します。

私は、完全に話題から外れていて、何が起こっていたとしても、興味を持って読み、すべてを理解できるような方法でイベントを説明しようとしました。

一般的に、これはモスクワ近郊で7月29日から8月4日に開催されたバイオインフォマティクススクールに関する投稿です。 詳細-猫の下。

注意、交通、カットなしのすべての写真!



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参加者、主催者、学校のスピーカー。



はじめに



そのため、4月頃、バイオインフォマティクス研究所はサマースクールで競争力のある選択の申請を受け入れ始めました。 これは、バイオインフォマティクスの分野におけるさまざまな分野での1週間のトレーニングであり、モスクワのどこかで宿泊費を支払って行われると述べられました。

ここで私は言わなければならない、そして私はこれまでのところ「トピックから外れている」と感じている読者にとって興味深いと信じている。 ちなみに、私もこのコースに偶然にたどり着きました。何か新しいことを聞きたかっただけです。

私自身はサンクトペテルブルク工科大学、情報技術および管理学部の出身で、主にC ++およびC ++ Qtでソフトウェアを開発しています。 一般的に、ご覧のとおり、最も一般的な技術者です。 バイオインフォマティクスの知人はいませんでしたが、当時、遠い同志がこのすべてを訪問するように助言してくれました。

私は申請書を提出しましたが、7月に受け入れられたことが通知され、すべての参加者と同様に、MSUからすべてが開催され、戻ってくる宿泊施設、食事、宿泊施設までの送迎が支払われます。



学校



最初の日は、クラスがモスクワ州立大学の生物学部で開催されたという点で他のすべてとは異なりました。 私は一日で来なければならなかったので、モスクワ州立大学の尖塔を眺める窓のある友人と一緒に夜を過ごしました。 希望する地点から直接アイコンタクトするエリアにいるので、問題なくそこに着くと確信していました。 しかし、午前中、バスが私にはあまり知られていない路線で行くことに少し驚いていました。そして、ほとんどのマスコビットはそこへの行き方を明確に答えることができません。 わいせつな言葉で満たされた長い話は飛ばし、途中で会った他の参加者のおかげでのみ会場に着いたと言います。



ちなみに、参加者については、セットの条件に従って、誰でも応募できましたが、IT専門家と生物学者が優先されました。 この2つの要素は、学校の組織にも反映されました。参加者は、それぞれフロー、生物学者、コンピューター科学者によって分けられ、象徴として、全員に発行されたTシャツに花とコンピューターが描かれました。 これがコンピューターであるかどうかについての真実は、私たち全員が決めていません。 ミラー、コンロ、テレビ、MacOSウィンドウなどのオプションがありました。 他のオプションはコメントで提供できます:)



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扇風機と換気扇、ストーブ、花とコンピューター。



そしてもちろん、学校にはすでに成熟したバイオインフォマティクス、つまり両方がありました。 その後、知識を交換するために小川を混ぜて部屋に入ろうとしたと自信を持って言われました。



モスクワ州立大学生物学部の聴衆の前で、Tシャツに加えて、バッジ、ノート、ペン、学校スポンサーのその他の帰属、およびスケジュールが与えられました。 フローのクラスが異なる場合があることに注意してください。

初日、それはすぐに興味深く、あまりはっきりしていませんでした(私は恐れていました)、幹細胞についての講演「体細胞の遺伝的再プログラミング:バイオインフォマティクスがもたらすこと」は特に興味深いものでした。 記事の途中で、コンテンツの特別な説明なしでいくつかの講義のみに言及します。すべてのビデオがこのページでまもなく利用可能になるので、何かに興味があれば、講義を見ることができます。

すべての公演後、メンデレーエボ近くの寄宿舎に行きました。 途中で、モスクワに住むのがどれほど悪いかを実感しました-私たちは2.5時間の旅をしました。



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居住地とトレーニング。



下宿にはトレーニングに必要なものすべてが揃っていました-インターネット(常に負荷から落ちていますが)、教室、ボード、ソケット。

私たちは多くのことを練習しました。多くの場合、夕方には10時から7時まで、時にはそれ以上でした。 しかし、人が疲れている場合-授業を受けたり寝たりする代わりに、彼が自然の中で散歩するのを邪魔する人はいません。

また、次の組織的な瞬間にも満足しました。いわゆる「コーヒーブレイク」-講義間のコーヒーブレイク。コーヒー自体の他に、紅茶とクッキーまたはその他のパンがありました。



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コーヒーブレイク



2日目も非常に簡単で、未経験者でもすべてが明らかであり、微生物学、細胞構造、細胞小器官などの基礎について彼らは(コンピューター科学者、生物学者には他の何かが並行してあった) 単体テストとPythonのパイプラインを使用した小さなタスクもありました。

夕方には、ゲノムの組み立てに関するレッスンゲームがありました。 一番下の行は次のとおりです。あなたは多くのチラシを読んで与えられます、そして、あなたのチームはできるだけ早くそれらを集めて、結果のゲノムを書き留めるべきです。 誰よりも速く、よりうまく対処する-それとスリッパ。 私たちのチームが勝ちました:)このゲームは、誰かがゲノムアセンブリとは何かを理解していなければ、それを明確に理解できるという点で便利です。 まあ、彼女はただ面白いです。



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賞を受賞した私たちのチーム。



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別の良いチーム:)



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正解。



翌日、Sergei Nurkから、 Counts de Bruyneとそのゲノムのアセンブルへの応用についての非常に講義が行われました。今夜、アセンブリを演じた人々は、コンピューターで同じことを素早く効率的に行う方法を理解できました。

バイオインフォマティクスのスタートアップについてもいくつか思い出しました。 興味深い会話や新しい情報がたくさんありました。助成金制度の仕組みを理解し、この分野ですでに経験を積んだ人たちの話を聞いて話をしました。



正直なところ、私はその日から覚えていませんが、すぐに夜のパーティーの伝統に入り始め、誰かが早朝のパーティーさえもしました。 ソーシャルゲームやボードゲームが含まれていました。HatMafiaEvolution 、および一部の人はアルコール含有飲料の使用です。 誰もがそのような公共のイニシアチブに参加したわけではありませんが、大多数が参加しました。 アルコールの不足から、プレイヤーの近くにミニバーが編成された面白い瞬間がありました。 この楽しい機能は、そこにいたすべての人に記憶されていたと思います:)



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ゲーム中にバックグラウンドでミニバー。



学生によるプレゼンテーション、いわゆるミニ会議もありました。 興味深い、多くの真面目なプロジェクト、多くの才能のある人が見つかりました。 プレゼンテーションも記録されたため、バイオインフォマティクスの将来に関心がある人は、学校の資料がサイトにアップロードされるまで待つ必要があります。 2ペアで13回の公演がありました。主観的に出てくるので、私は誰も強調しませんが、見るべきものがあります。



金曜日と土曜日に、彼らはBLASTについて、より正確にはそのデバイスについて話しました。 BLASTは、タンパク質とヌクレオチドの配列間の類似性を見つけるためのツールです。 講義では、これらのシーケンスの一致の重要性を評価し、区別することを可能にする統計的方法が分析されました

ランダムからの本当に非ランダムな偶然。 一般的に、歓声、それは確率とマットの元ネイティブ理論でした。 統計。

土曜日には、遺伝子調節の合成ネットワークのダイナミクスにも耳を傾けました。非常に興味があり、これについては以前知りませんでした。 この分野では、体内のさまざまなプロセスを制御する実際の遺伝子ネットワークの機能を数学的モデリングによって研究しています。 これらのモデルを使用して、遺伝子ネットワークの複雑なダイナミクスを予測および分析し、これに基づいて、特定の個人的および集合的特性を備えた合成ネットワークおよび細胞システムを意図的に設計することができます。



そして、写真を撮りました(投稿の最初の写真)、写真をたくさん撮りました:) gifさえあります。 集合写真の後に、いくつかの講義があり、その後、主催者から親切に提供された食べ物や飲み物、社交、ゲーム、さらにはダンスまでの送別会がありました。 スピーカーで車を運転したスピーカーのアンドレイ・アファナシエフ同志が後者を担当します:)一般的に、完全なランプのような夜(そして朝に誰かの夜が流れる)には、物語のある火だけが欠けていました。 いずれにせよ、別れるのは不快で、ただお互いに慣れました。



おわりに



一般的に、学校は成功と成功でした。 もちろん、まず第一に、社会的に-人々はお互いを知り、科学の知り合いは多くのことを意味します。将来、これらの人たちが共同プロジェクトを始めたり、この学校のおかげでバイオインフォマティクスと結びつけることになっても驚かないでしょう。 これは、非公式の環境で勉強するとき、あなたが話し、夕方に楽しい人との楽しい会社で勉強するときに素晴らしいです。 質の低い大学で行われているように、教科書を読んでいる教師ではなく、その分野の専門家や実践があなたに経験を移すのは素晴らしいことです。 そしてもちろん、あなたが本当に要求されている分野、未来の科学に自分自身を紹介していると感じるのは素晴らしいことです。 しかし、いつものように、忍耐と決意が必要です。



この学校は私たちの主催者の最初の練習であり(感謝を参照)、初めて、普通の参加者の主観的な意見では、すべてが最高レベルです。 はい、不快な瞬間がありましたが、それは主催者に依存しませんでした、例えば、のどの痛みの素晴らしい流行など、最終的に私たちはそれを恐れるよりも同じ狭心症をからかう可能性が高くなりました(証明書を参照)。 そうでなければ、文句を言うことは何もありません。私たちの国では珍しいことであり、再びそこに行きたいという願いと願望しかありません。



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学校への参加証明書。



あとがき



謝辞


学校のすべての参加者に代わって、次の同志に努力と楽しい感情の束を得る機会に再び感謝します。



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そして、もちろん、すべてのスピーカー、そして私たち、参加者にも。



参加者向け


この涼しい一週間をありがとう、すべてが非常に暖かく、友好的な方法で出てきました。 私は廊下に十分な夜の集まりがありません。

実行しないでください、そうでなければ、いつものように、彼らはVKで友達にお互いを追加して忘れました。 うまくいきません:)



Khabrovitesとサンクトペテルブルクに住んでいる読者のみ


バイオインフォマティクス研究所は、生物学者向けの アルゴリズムバイオインフォマティクスおよびバイオインフォマティクスプログラムに学生を登録し続けています。



みんなのために


主催者は、おそらく来年、学校が再び開催されると言いました。今回はサンクトペテルブルクで計画されています。 読者の皆さん、上記が気に入ったら、1年で運を試してから応募してください。



すべての科学、さようなら。



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